《孫詒讓《名原》研究》
潘美月、杜潔祥主編《古典文獻研究輯刊》第四編第26冊，花木蘭文化出版社，2007年3月出版（原為東吳大學中國文學研究所碩士論文，237面，1999年6月，許錟輝先生指導）
《孫詒讓《周禮》學研究》（上）（下）
林慶彰主編《中國學術思想研究輯刊》第十七編第5冊、第6冊，花木蘭文化出版社，2013年9月出版（原為東吳大學中國文學研究所博士論文，374面，2006年8月，林慶彰先生指導）
《下輩子，投胎到英國》
日本，SUZUSAWA書店，2024年11月出版，287面
A《文獻學讀書記》（合撰）
北京，三聯書店，2018年9月出版，簡體字橫排499面
B《學術史讀書記》（合撰）
北京，三聯書店，2019年1月出版，簡體字橫排510面
C《朱門禮書考》（合撰）
日本，SUZUSAWA書店，2023年7月，254面
《中國經學史大綱》
北京大學出版社，2016年8月，508面
《朱駿聲《說文通訓定聲》概述》
《東吳中文研究集刊》第4期，1997年5月，頁83-106
《海峽兩岸點校「史部」古籍的回顧與檢討》（合撰）
中央研究院中國文哲研究所《中國文哲研究通訊》第11卷第3期，2001年9月，頁215-249
《清乾嘉學者研治《周禮》的貢獻》
2001年11月22、23日中央研究院中國文哲研究所籌備處舉辦「清代乾嘉學者的治經貢獻」第二次學術研討會會議論文，共27頁
《魏晉經學的定位問題》
臺灣學生書局《經學研究論叢》第10輯2002年3月，頁9-36
《孫詒讓的輯佚成果──《周禮三家佚注》》
《書目季刊》第37卷第3期，2003年12月16日，頁49-78
原發表於2003年10月1日東吳大學中國文學系「92學年度第1學期教師常態性學術研討會」
《孫詒讓校勘《周禮》的成果──《周禮注疏校記》》
2005年6月23、24日中央研究院中國文哲研究所舉辦「浙江學者的經學研究」第一次學術研討會會議論文，共25頁
《孫詒讓《周禮‧職方氏》解》
浙江大學古籍研究所編《禮學與中國傳統文化──慶祝沈文倬先生九十華誕國際學術研討會論文集》（浙江大學古籍研究所中國古典文獻學研究叢書），北京，中華書局出版，2006年12月，頁200-213
原發表於2006年6月20、21、22日浙江大學古籍研究所召開「禮學與中國傳統文化──慶祝沈文倬先生九十華誕國際學術研討會」，共15頁
《《古今圖書集成‧經籍典‧周禮部》的文獻價值》
中央研究院中國文哲研究所《中國文哲研究通訊》第16卷第4期，2006年12月，頁103-120
《曹元忠、曹元弼之生平與著述》
2007年5月9日東吳大學中國文學系95學年度第2學期「教師常態性學術研討會」會議論文，共37頁
《經學變形記──晚清學者以西學比附中國經學現象之探析》B
臺北市立教育大學人文藝術學院儒學中心《儒學與語文學術研討會論文集》，2008年12月，頁43-64
原發表於2008年11月5日臺北市立教育大學「人文藝術學院儒學中心」舉辦「儒學與語文學術研討會」，共18頁
《郭明昆的生平及其《儀禮‧喪服》的研究》
臺北市立教育大學「人文藝術學院儒學中心」《儒學研究論叢──日據時期臺灣儒學研究專號》2008年12月，頁163-178
原發表於2007年12月29日臺灣大學‧國科會人文中心舉辦「臺灣儒學研讀會」第二次會議，共11頁。文中介紹分析郭明昆《儀禮喪服考》的部分，也收錄於論文集B，作為《郭明昆對西方人類學理論的接受與利用》附錄
《鄭玄《周禮注》從違馬融《周官傳》考──兼論漢人師法、家法之議與曹元弼「子鄭子非馬融弟子考」》B
中央研究院中國文哲研究所《中國文哲研究通訊》第19卷第1期，2009年，頁157-192
原發表於2008年4月15日臺灣大學‧國科會人文學研究中心會議室「國科會人文中心青年學者論壇」，正文18頁，附錄12頁，共30頁
《楊復再修《儀禮經傳通解續卷祭禮》出版說明》BC
《版本目錄學研究》第二輯，北京，國家圖書館出版社，2010年12月，頁161-188
收入中國文哲研究所出版該書卷首及個人論文集BC，標題均將「出版說明」改作「導言」。
《影印宋刊元明遞修本《儀禮經傳通解》正續編編後記》AC
《版本目錄學研究》第三輯，北京，國家圖書館出版社，2012年1月，頁59-84
《理解版本的方法與效用》A
《儒家典籍與思想研究》第四輯，北京大學出版社，2012年4月，頁260-272
《朱熹、黃榦及楊復祭禮學的形成》BC
《文史》2013年第四輯，2013年11月，頁145-162，中華書局，
《金刻本《周禮》商榷》（合撰）A
《版本目錄學研究》第五輯，北京大學出版社，2014年6月，頁511-529
《聶崇義《三禮圖》版本印象——紀念多一種蒙古時期山西刻本的發現》（合撰）A
《版本目錄學研究》第五輯，北京大學出版社，2014年6月，頁485-500
《朱熹《儀禮經傳通解》對《禮記》經、傳的界定》BC
《哲學門》第15卷第1冊（總第29輯），北京大學出版社，2014年6月，頁11-34
《影印南宋越刊八行本《禮記正義》編後記》（合撰）A
《版本目錄學研究》第六輯，北京大學出版社，2015年6月，頁227-244
《《孝經孔傳述議讀本》編後記》（合撰）B
《中國經學》第十六輯，廣西師範大學出版社，2015年8月，頁77-96
《學《中國版刻圖錄》記》（合撰）A
《版本目錄學研究》第七輯，北京大學出版社，2016年12月，頁49-62
《郭明昆對西方人類學理論的接受與利用》（合撰）B
《存在交涉——日據時期的臺灣哲學》，聯經出版公司，2016年
《孫詒讓《周禮正義》「鄭非經旨」、「賈非鄭意」辨》B
《中國經學》第二十一輯，廣西師範大學出版社，2017年11月，頁69-90
又收錄於張素卿主編《清代漢學與新疏》，五南圖書公司，2020年1月，頁251-285
Should it be Regarded Part of the Traditional Mainstream Scripture Study? Two Reports in the First International Conference on East Asian Cultures, Held by RCEAC, St Anne’s College（合撰）
《青山国際政経論集》第108輯，2022年5月，頁177-200
《楊復注《家禮》的意義與後世的變化》（合撰）C
《中國經學》第三十輯，廣西師範大學出版社，2022年11月，頁107-129
《被主流遮蔽的儒家經學特質——西學與鄭玄的啟示》
《國際儒學（中英文）》2023年第三期，國際儒學聯合會、清華大學，2023年9月，頁39-47（上揭Should it be……之譯文，張樂之譯）
《專科目錄「附錄」的檢討》
《專科目錄的編輯方法》臺灣學生書局，2001年9月，頁77-106
《虛詞的檢索與利用》
《學術資料的檢索與利用》萬卷樓圖書公司，2003年3月，頁273-283
《器物圖象的檢索與利用──以青銅器為例》
《學術資料的檢索與利用》萬卷樓圖書公司，2003年3月，頁381-395
《羅振玉在日本》
《近代中國知識分子在日本》第2冊，萬卷樓圖書公司，2003年7月，頁91-121
《郭沫若在日本》
《近代中國知識分子在日本》第3冊，萬卷樓圖書公司，2003年7月，頁227-265
《訪當代三禮學專家──彭林教授》林慶彰採訪，葉純芳整理
《經學研究論叢》第11輯，臺灣學生書局，2003年6月，頁381-400
《大陸高校古籍整理的領航者──安平秋教授》林慶彰採訪，葉純芳整理
《國文天地》第255期「學林人物」，萬卷樓圖書公司，2006年8月，頁107-111
《在卡片堆裡的活工具書──張錦郎教授》葉純芳採訪整理
《國文天地》第265期「學林人物」，萬卷樓圖書公司，2007年6月，頁101-105
《創造中國文化出版界的奇蹟──專訪華東師範大學出版社朱傑人社長》林慶彰採訪 葉純芳整理
《國文天地》第269期「學林人物」，萬卷樓圖書公司，2007年10月，頁101-105
《潛心明清出版文化研究──訪大木康教授談馮夢龍和相關問題》林慶彰採訪 葉純芳整理
《國文天地》第281期「學林人物」，萬卷樓圖書公司，2008年10月，頁103-107
《談《經學研究論叢》與《國際漢學論叢》──兼談「以書代刊」的學術價值與困境》
《國文天地》第288期（第24卷第12期），2009年5月，頁29-31
《文字學之巨擘──許錟輝教授的學思歷程》葉純芳採訪整理
《國文天地》第289期「學林人物」，萬卷樓圖書公司，2009年6月，頁103-107
《我的圖書館經歷》
《國文天地》第297期（第25卷第9期），2010年2月，頁25-28
《漢代政治文化的探索者──陳蘇鎮教授的學思歷程》葉純芳採訪整理
《國文天地》第329期「學林人物」，2012年10月，頁109-113
《生活三分》專欄
連載於網路雜誌《Mercure des Arts》https://mercuredesarts.com/
《Relish Expert》 2022年8月15日
《葉山小書店》 2022年10月15日
《學才藝》 2022年11月15日
《觀音》 2022年12月15日
《師生》 2023年1月15日
《食的二三事》2023年2月15日
《靜嘉堂抄書記》 2023年3月15日
《書目季刊》「新書提要」欄目
碩士班就學期間多次撰寫
《經學研究論叢》「出版資訊」欄目
博士班就學期間多次撰寫新書提要
林慶彰先生國科會「民國以來經學書目提要(1949─1998)」計劃
撰作《三禮》提要
《景榆岾寺本《龍龕手鏡》解說》〔日〕藤塚鄰撰
《版本目錄學研究》第一輯，北京，國家圖書館出版社，2009年10月，頁165-172
《村本文庫藏王校本《白氏長慶集》——走向宋刊本》（共譯）〔日〕平岡武夫撰
《版本目錄學研究》第四輯，北京大學出版社，2013年8月，頁297-324
《孝經述議復原研究》（共同編譯） 〔日〕林秀一撰
武漢，崇文書局，2016年6月
《師顧堂影印金澤文庫本《春秋經傳集解》解題》（共譯）〔日〕齋藤慎一郎撰
《版本目錄學研究》第十二輯，北京，國家圖書館出版社，2020年11月，頁97-115
《說文解字注》（共同校勘）〔清〕段玉裁撰
臺北，黎明文化事業公司，1998年
《汪中集》（共同點校）〔清〕汪中撰
臺北，中央研究院中國文哲研究所籌備處，2000年3月，556面
《朱彝尊研究資料彙編》（合編）
收錄於林慶彰、蔣秋華主編《朱彝尊經義考研究論集（上、下）》，中央研究院中國文哲研究所籌備處，2000年9月
《陳奐相關資料彙編》（合編）
收錄於林慶彰、楊晉龍主編《陳奐研究論集》，中央研究院中國文哲研究所籌備處，2000年12月
《臧在東年譜》（共同點校）〔日〕吉川幸次郎撰
《經學研究論叢》第11輯，臺灣學生書局，2003年6月，頁353-379
《近代中國知識分子在日本》（1-3）（共同編輯）
臺北，萬卷樓圖書公司，2003年7月
《晚清經學研究文獻目錄（1901-2000）》（共同編輯）
中央研究院中國文哲研究所，2006年10月，共一冊865面
《儒學研究論叢──日據時期臺灣儒學研究專號》（葉純芳、張曉生主編）
臺北市立教育大學「人文藝術學院儒學中心」，2008年12月
《經義考新校》（負責《三禮》部分校勘工作，擔任校勘記整合撰寫工作）
上海古籍出版社，2010年12月
《楊復再修儀禮經傳通解續卷祭禮》（共同策劃、編輯、點校）
臺北，中央研究院中國文哲研究所，2011年9月出版，共三冊1075面
《影印宋刊元明遞修本儀禮經傳通解正續編》（共同策劃、編輯）
北京大學出版社，2012年6月，共三冊2069面
《影印南宋越刊八行本禮記正義》（共同策劃、編輯）
北京大學出版社，2014年6月，共三冊1739面
《孝經孔傳述議讀本》（共同策劃、編輯）〔隋〕劉炫撰
日本，葉山小書店出版部，2015年8月，244面
《影印南宋官版尚書正義》（共同策劃、編輯）
北京大學出版社，2015年11月，共一冊639面
《朱熹禮學基本問題研究》（共同策劃、編輯）
北京，中華書局，2015年9月，517面
《影印南宋官版周易正義》（共同策劃、編輯）
北京大學出版社，2017年6月，共一冊356面
《影印金刻本婺州本周禮》（共同策劃、編輯）
北京大學出版社，2023年3月，共二冊，上冊458面下冊406面